Software-Probleme bei der Optimierung von Geschäftsprozessen

Hallo zusammen, ich stecke seit Wochen in einem echten Dilemma. In meiner Firma sollen wir ein neues Software-System einführen, das den gesamten Betriebsablauf optimieren soll. Leider gibt es ständig Probleme mit der Anpassung an unsere spezifischen Anforderungen. Wir arbeiten im Gesundheitswesen, und jedes Software-Modul, das wir testen, scheint entweder zu kompliziert oder zu unflexibel zu sein. Hat jemand von euch Erfahrungen mit maßgeschneiderter Softwareentwicklung und kann mir da weiterhelfen?